Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDP1Q9Y5B0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDP1Q9Y5B0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms