Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms