Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GNEQ9Y223 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNEQ9Y223 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNEQ9Y223 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms