Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM33Q9UPN9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms