Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN4Q9UJW0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms