Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLIP2Q9UDT6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms