Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLN8Q9UBY8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLN8Q9UBY8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms