Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DKK2Q9UBU2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms