Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms