Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
XCL2Q9UBD3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCL2Q9UBD3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms