Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP28Q9P2N2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms