Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC59Q9P031 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms