Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.261e-6■■■□□ 15
AATFQ9NY61 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.81e-6■■■□□ 15
AATFQ9NY61 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 218.79■□□□□ 0.61e-6■■■□□ 15
AATFQ9NY61 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.381e-6■■■□□ 15
AATFQ9NY61 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 314.62□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 15
AATFQ9NY61 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 317.78■□□□□ 0.441e-6■■■□□ 15
AATFQ9NY61 PTBP1-211ENST00000587094 273 ntTSL 314.14□□□□□ -0.157e-7■■■□□ 14.9
AATFQ9NY61 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.612e-7■■■□□ 14.9
AATFQ9NY61 GNPTG-205ENST00000527168 1317 ntTSL 528.31■■■□□ 2.123e-6■■■□□ 14.9
AATFQ9NY61 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.953e-6■■■□□ 14.9
AATFQ9NY61 GNPTG-208ENST00000529957 922 ntTSL 527.08■■□□□ 1.933e-6■■■□□ 14.9
AATFQ9NY61 GNPTG-209ENST00000534197 420 ntTSL 327.08■■□□□ 1.933e-6■■■□□ 14.9
AATFQ9NY61 GNPTG-206ENST00000527876 550 ntTSL 426.77■■□□□ 1.883e-6■■■□□ 14.9
AATFQ9NY61 GNPTG-207ENST00000529110 552 ntTSL 226.76■■□□□ 1.873e-6■■■□□ 14.9
AATFQ9NY61 GNPTG-202ENST00000526820 572 ntTSL 323.59■■□□□ 1.373e-6■■■□□ 14.9
AATFQ9NY61 PKP3-206ENST00000528036 940 ntTSL 228.22■■■□□ 2.118e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 PKP3-210ENST00000533249 1111 ntTSL 328.05■■■□□ 2.088e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 PKP3-211ENST00000534401 756 ntTSL 325.97■■□□□ 1.758e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 PKP3-205ENST00000527442 847 ntTSL 325.3■■□□□ 1.648e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 PKP3-208ENST00000531857 687 ntTSL 421.31■■□□□ 18e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 PKP3-209ENST00000533069 590 ntTSL 220.28■□□□□ 0.848e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.818e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.639e-7■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 TUBA1C-203ENST00000548470 1105 ntTSL 214.11□□□□□ -0.159e-7■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 TUBA1C-209ENST00000552448 1800 ntTSL 312.44□□□□□ -0.429e-7■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.549e-7■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.619e-7■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 AP3D1-209ENST00000591284 580 ntTSL 523.34■■□□□ 1.331e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.631e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.541e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 SLC26A6-211ENST00000431739 588 ntTSL 318.03■□□□□ 0.481e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 SLC26A6-209ENST00000426599 555 ntTSL 417.37■□□□□ 0.371e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 SLC26A6-220ENST00000489483 5682 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.141e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 SLC26A6-201ENST00000307364 2586 ntTSL 1 (best)14.99□□□□□ -0.011e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.091e-9■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.374e-6■■■□□ 14.8
AATFQ9NY61 DYRK1A-209ENST00000608928 483 ntTSL 526.59■■□□□ 1.851e-8■■■□□ 14.7
AATFQ9NY61 TFRC-215ENST00000491658 396 ntTSL 52.04□□□□□ -2.084e-12■■■□□ 14.7
AATFQ9NY61 DAZAP1-209ENST00000590419 508 ntTSL 317.81■□□□□ 0.447e-7■■■□□ 14.7
AATFQ9NY61 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.984e-6■■■□□ 14.7
AATFQ9NY61 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.14e-6■■■□□ 14.7
AATFQ9NY61 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 FASN-211ENST00000637026 100 ntTSL 512.5□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 ZNF251-204ENST00000530353 2342 ntTSL 225.85■■□□□ 1.734e-8■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 ZNF251-202ENST00000524394 315 ntTSL 519.78■□□□□ 0.764e-8■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 ZNF251-203ENST00000525191 618 ntTSL 318.36■□□□□ 0.534e-8■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-8■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MTA1-209ENST00000469140 1666 ntTSL 528.11■■■□□ 2.092e-10■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DHCR7-209ENST00000531364 507 ntTSL 427.09■■□□□ 1.937e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DHCR7-206ENST00000527316 1005 ntTSL 526.35■■□□□ 1.817e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 YDJC-205ENST00000468686 1423 ntTSL 1 (best)25.8■■□□□ 1.727e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DHCR7-208ENST00000529990 525 ntTSL 425.68■■□□□ 1.77e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 YDJC-207ENST00000482998 1388 ntTSL 523.9■■□□□ 1.427e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 YDJC-204ENST00000464015 1613 ntTSL 1 (best)22.9■■□□□ 1.267e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 YDJC-206ENST00000473985 1494 ntTSL 522.68■■□□□ 1.227e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DUS1L-204ENST00000542088 1040 ntTSL 322.24■■□□□ 1.157e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 YDJC-203ENST00000415762 1410 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.137e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.117e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.17e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.067e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.037e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DUS1L-203ENST00000538833 1250 ntTSL 1 (best)21.42■■□□□ 1.027e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)21.29■■□□□ 17e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 17e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.987e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.977e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PSMB4-206ENST00000495288 986 ntTSL 220.92■□□□□ 0.947e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.937e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.937e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.917e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.97e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DHCR7-204ENST00000525346 520 ntTSL 420.55■□□□□ 0.887e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 ANKRD30BL-204ENST00000470729 1425 ntTSL 1 (best)20.51■□□□□ 0.877e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.877e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DUS1L-213ENST00000580731 725 ntTSL 520.35■□□□□ 0.857e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.767e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PSMB4-205ENST00000493673 1650 ntTSL 519.27■□□□□ 0.677e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DUS1L-209ENST00000578428 688 ntTSL 219.02■□□□□ 0.647e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.537e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.527e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.517e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)18.14■□□□□ 0.497e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)18.04■□□□□ 0.487e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.477e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DUS1L-205ENST00000577574 473 ntTSL 517.94■□□□□ 0.467e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.467e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.437e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.427e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DHCR7-207ENST00000527452 579 ntTSL 417.6■□□□□ 0.417e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.47e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.387e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 CASP2-202ENST00000350623 1146 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.367e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 DUS1L-212ENST00000579854 657 ntTSL 217.25■□□□□ 0.357e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.347e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.267e-6■■■□□ 14.6
AATFQ9NY61 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)16.67■□□□□ 0.267e-6■■■□□ 14.6
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