Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MS4A12Q9NXJ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms