Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TOR4AQ9NXH8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR4AQ9NXH8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms