Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPRD1BQ9NQG5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPRD1BQ9NQG5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPRD1BQ9NQG5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPRD1BQ9NQG5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPRD1BQ9NQG5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPRD1BQ9NQG5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPRD1BQ9NQG5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms