Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYLDQ9NQC7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYLDQ9NQC7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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