Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX9Q9NQ69 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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