Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2TQ9NPD8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2TQ9NPD8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms