Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1B3Q9NPD5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms