Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF2Q9HAK2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF2Q9HAK2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms