Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLMPQ9H6B4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLMPQ9H6B4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms