Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms