Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTR3CQ9C0K3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTR3CQ9C0K3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms