Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER1Q9C0I3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms