Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NMES1Q9C002 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMES1Q9C002 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms