Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms