Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECSITQ9BQ95 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms