Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms