Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms