Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBGCP5Q96RT8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms