Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GBP4Q96PP9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms