Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF558Q96NG5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 334.6 ms