Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNBD2Q96M20 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms