Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG2Q96IQ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms