Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPNQ96H22 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms