Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms