Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VTI1AQ96AJ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms