Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA10Q969M2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA10Q969M2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms