Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1CQ92928 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms