Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCG3Q8WXD2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms