Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF398Q8TD17 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF398Q8TD17 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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