Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PROKR1Q8TCW9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms