Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM1Q8TC05 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms