Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCPH1Q8NEM0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCPH1Q8NEM0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms