Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COLGALT1Q8NBJ5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms