Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RPAP2Q8IXW5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms