Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LDLRAD3Q86YD5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms