Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SV2BQ7L1I2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms