Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDZD4Q76G19 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms